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科技專項經費撥款可以計入應納稅所得額。根據《中華人民共和國企業所得稅法》實施細則第三十九條之規定，企業按照有關規定取得的科技支出收益，如獲得政府專項科技撥款等，均計入企業所得稅應納稅所得額。需要注意的是，企業應當按照有關規定獲得的科技支出收益，應當依法繳納企業所得稅，并具備相應的證明文件。 
 
拓展知識：企業科技支出收益包括科技項目收益、創新獎勵收益、科技轉移收益和技術認證收益等，這些收益都需要按照有關規定辦理企業所得稅手續，并計入應納稅所得額。