農產品收購發票的稅率主要取決于農產品的類型、所在地區的財政政策等因素，國家一般會制定出基本稅率以及一些特殊情況下的稅收減免政策，各地也可根據本地實際情況適當調整稅率。

具體來看，根據國家稅務總局相關規定，農產品收購發票中的六類農產品（水果、蔬菜、肉類、畜禽及其制品、農產品加工制品、其他），一般無論是哪個地方，都使用3%的稅率。其中豆類、稻谷及其制品、雜糧及其制品，在政府推行糧食稅率優惠政策時，可收取2%的稅率。

此外，國家在特殊的時候可能會出臺一些臨時性的財稅政策，例如，今年3月，國家出臺的臨時全國社會保障費稅率下調政策，一些特定的農產品收購發票也可從4%的稅率減少到3%。

因此，農產品收購發票的稅率由具體的農產品的類型、所在地區的財政政策以及地方政府可能出臺的稅收減免政策等因素共同決定，一般情況下稅率為3%，有時候也可以享受減稅的政策。

拓展知識：

依據《稅收征管法》規定，農產品收購發票在使用時，還必須符合一定的格式，且發票上應當注明農產品收購的品名、數量、單價及稅率等信息，才能被依法承認具有減免稅款的收購票據，從而為收購企業節約稅費。