預收三年的租金應當納稅。根據《中華人民共和國會計法》第四十五條的規定，企業對長期負債或預收賬款的納稅應以這些負債（預收賬款）紕繆，按年分期繳納。

一般而言，預收三年的租金均應按季度分期繳稅，即每季度繳稅；或者現金收取三年的租金，將一年的租金繳稅，由此可以解決稅務機關對企業“拖欠稅款”的疑問。

繳稅應按照企業所得稅收入計提稅金的規定，將收取的租金收入列入企業所得稅收入，并依據企業所得稅法律法規中規定的收入種類（一般收入和營業外收入），進行計稅。

企業應建立健全所得稅收入計提、稅務報告和稅款繳納等系統，以便確保完全符合收入稅法的各項規定。繳稅前，應進行準確的稅費計算，以確保所收取的租金實現正確的繳稅，以減少企業的稅務負擔。

此外，預收三年租金的形式，企業也可以考慮將預收租金進行投資，以獲得合理的投資收益，從而降低企業稅收負擔。

總之，納稅要求企業應當按照法律、法規及其情況進行合理的繳稅，以減輕企業的稅收負擔。

拓展知識：

除了納稅，企業還應當對預收租金的收付情況進行管理和控制，重要的是在信息化管理的基礎上，采取合理的措施，建立健全的分類賬簿，有效的控制企業財務風險和維持預收租金的正常流轉。