企業補交印花稅滯納金網上操作流程是：

一、登錄網上繳款系統

首先，我們需要登錄網上繳款系統，登錄網頁：https://www.boco.cn/webpayment/ 點擊后會跳出一個登錄頁面，我們需要輸入正確的用戶名和密碼進行登錄，登錄成功后即可進入網上繳款系統；

二、進入印花稅繳款頁面

在網上繳款系統的首頁，會有滯納金查詢入口，點擊后即可進入印花稅滯納金繳納頁面；

三、填寫補交滯納金信息

在補交滯納金頁面，我們需要填寫補交滯納金的信息，包括：所屬機構、征收機關印花稅號、主管稅務機關編碼、稅種、繳款期限、繳款金額，這些信息是必填項，我們需要正確填寫；

四、印花稅繳款

在填寫完補交滯納金的相關信息后，點擊提交按鈕，即可開始繳納印花稅滯納金了。企業可以通過支付寶、微信、網銀等方式進行繳款，繳款完成后，系統會發出一個繳款憑證，說明補交滯納金交易已經完成。

以上是企業補交印花稅滯納金網上操作的流程，在網上繳款前，企業還可以進行滯納金查詢，以確保所補交的滯納金是正確的。另外，國家稅務機關也會定期發布補交滯納金的優惠政策，企業可以及時關注，以獲得較多的優惠。

拓展知識：

印花稅是指政府收取的用于補充國家財政的一種財政稅收，是一種財政法定稅收，是國家為公益事業及收入分配的一種財政收入。主要涉及金融證券買賣、質押、再質押、債券、股權投資等交易。印花稅的征收對象是所有參與金融證券交易行為的單位和個人，受稅財產主要包括債券、股權等金融證券財產，印花稅的稅率一般由地方人民政府自行確定。