失控的發票增值稅及企業所得稅應該根據國家相關法律進行處理。首先，企業必須按照《中華人民共和國增值稅暫行條例》的規定為發票定義和管理，以確保發票的真實性和準確性。此外，企業應根據有關規定，妥善保存企業稅務的有效記錄——發票，包括企業收款確認單。

其次，當企業發現發票失控時，首先應立即向稅務機關報告。稅務機關會根據企業提供的有效憑據進行核實，如果憑證失控，則會責令企業改正或處理。

此外，如果憑據失控超過一定期限，則企業應格外注意檢查增值稅，即進行“發票清查”。發票清查是指對有關發票資料和記錄進行全面清理，以確保發票真實可靠。

最后，對于企業被稅務機關發現失控發票增值稅及企業所得稅，企業需要按照稅務機關的要求改正，并及時更正發票記錄，同時補交相應的稅款。

拓展：對于企業稅務，一個重要的原則是合規稅務，尤其是企業在開具發票時應當特別注意，否則可能會遭到稅務機關的傾覆。此外，為了避免失控發票，企業也應當按照《中華人民共和國增值稅管理條例》的規定，采取電子數據備案制度，并核實發票記錄，以確保稅務合規性。