運輸發票稅率的區別主要體現在稅收的計算上。稅率是指稅收與稅基的比率，通常以百分比表示。在中國，運輸發票的稅率通常為6%或9%。這兩個稅率的區別主ly在于稅收的計算方式和稅收的金額。

首先，稅率的計算方式不同。6%的稅率通常用于增值稅普通發票，而9%的稅率通常用于增值稅專用發票。增值稅普通發票的稅額是通過銷售額乘以稅率計算的，而增值稅專用發票的稅額是通過銷售額除以（1+稅率）計算的。這意味著，對于同樣的銷售額，增值稅專用發票的稅額會比增值稅普通發票的稅額高。

其次，稅收的金額也不同。6%的稅率意味著每銷售100元，需要繳納6元的稅，而9%的稅率意味著每銷售100元，需要繳納9元的稅。這意味著，對于同樣的銷售額，9%的稅率會比6%的稅率繳納更多的稅。

拓展知識：在中國，增值稅是國家的主要稅收來源之一。增值稅的稅率通常分為6%、9%和13%三檔。6%的稅率主要適用于服務業，如金融業、房地產業等；9%的稅率主要適用于運輸業、建筑業等；13%的稅率主要適用于商品銷售和進口等。此外，對于一些特定的商品和服務，如農產品、書籍、教育服務等，還有一些特殊的稅率。