開辦費在匯算清繳時應如何扣除？開辦費是指企業按照相關制度或者規定，在正式注冊登記營業執照的過程中向國家機關支付的費用。

在國內稅收管理中，開辦費是企業正常運營中的一項開支，企業在匯算清繳時也應抵扣開辦費，但應該按照相關稅法規定來進行。

首先，企業需要準備幾份關于開辦費支付的相關文件，這些文件包括開辦費的收入憑證、支出憑證和發票等；其次，根據稅法，應交稅的開辦費是指企業在合規支付的情況下，符合稅法規定的管理機關向企業收取的開辦費及其他費用；最后，企業在匯算清繳時，根據國家有關稅收政策，在合法的權限范圍內，可以全額抵扣當期的開辦費。

在匯算清繳中，企業不得非法抵扣開辦費，否則可能會受到相應的處罰。此外，企業在抵扣開辦費時，應嚴格遵守稅收制度，如經營者應持有效的開辦費收支憑證，取得開辦費抵扣資格，并區分該應稅及免稅場景。

總之，企業在進行匯算清繳時，應該根據有關稅收制度，以及收入憑證、支出憑證和發票等文件，合法抵扣開辦費。此外，企業在開辦費抵扣方面，還可以根據上級稅務部門的指導意見，及時調整抵扣方案，并充分發??企業稅務管理人員的稅務知識，便于企業合法抵扣開辦費，更好地服務企業的正常生產經營。

拓展知識：根據我國《企業所得稅法》規定，企業稅收抵扣開辦費時，應滿足一定的稅收準入條件，具體情況可能因企業而異，企業稅收抵扣都要依據有關稅收政策及法律法規，以方便企業依法抵扣開辦費稅收，避免納稅風險。