事業單位的成本核算是指根據企業業務發展的實質，對企業經營活動所涉及的各項費用進行統一的核算，以按照規定的標準衡量企業經營活動成果的過程。企業的經營活動涉及金錢、物資、勞動等非物質可計量的因子，這些因子影響著企業的收入與支出，而對經營活動進行合理的成本核算，不僅有助于企業準確地衡量成本，而且也可以有效控制成本，為管理者提供必要的判斷依據，從而實現企業經營管理的及時有效的進行。

成本核算的具體操作，一般分為兩部分：一是費用核算，即統一登記賬簿，記錄各類費用，確定各類費用的總額；二是支出核算，要求在實施支出報銷時，按照財務政策作出充分的說明，保證每一筆支出的實質、數量、金額、用途等的真實可靠，并必須加以記載。

此外，事業單位還應掌握各類收入與支出的核算方法，比如按照實際支出的定額核算法、完全成本核算法、合理分配核算法等進行費用核算。拓展知識：事業單位核算成本還應考慮到管理成本，主要包括組織管理費用、資產管理費用、人力資源管理費用、技術服務費用以及其他管理費用等。