外購存貨發生短缺的會計處理是企業財務會計的一個重要問題，企業在處理這種情況時應多加注意。

一般情況下，企業應采取直接從供應商處購買的方式來填補存貨短缺部分，同時，企業還要向供應商索取費用等付款。在企業采取補充外購存貨的行動過程中，應按照正常程序登記，明確購買時間、數量、價格、供應商等，并錄入至會計賬簿。

對于外購存貨短缺的會計處理，還需要考慮不同科目的會計登記和處理規則。對于庫存科目，存貨明細賬的期末余額要加上本期外購的數量；而在應付賬款科目，要將本期進貨額錄入應付賬款科目下，并設立外購存貨明細帳，登記外購存貨數量、價格、付款情況等。

此外，外購存貨發生短缺的會計處理還要審查庫存質量，并及時處理不合格品，進行合規處理，以達到精確核算存貨數量的目的。

拓展知識：

外購存貨發生短缺，企業除了要考慮妥善處理貨物本身，還要注意保留證據，以確定最終的責任，以減少損失。此外，企業應定期對庫存進行清點，并建立庫存監督機制，進行實時監控，以便及時發現并解決庫存短缺問題，防止業務中斷。