建筑施工企業掛靠經營的會計處理其實并不復雜，但是需要建立一套完整的制度，為掛靠企業的財務處理提供合理的指導。

首先，要明確工程掛靠經營的活動分類，以便做出相應的賬務處理，從而更好地把握收入和支出的情況。其次，施工企業對掛靠企業所提供的服務，應建立完善的收費制度，明確收費方式或價格，以及服務的內容，以免出現收費不當的情況。

此外，施工企業應對掛靠企業的管理制度進行加強，把掛靠企業的財務處理工作，歸入合同經營管理體制，合理制定掛靠企業的內部審計制度，進行審計，以便發現和消除掛靠企業中的隱患。

最后，施工企業必須建立一套完善的掛靠企業財務處理制度，規范和指導掛靠企業的財務處理，督促掛靠企業負責任地履行合同，以保證施工企業的財務安全。

拓展知識：除了對掛靠企業的會計處理，施工企業還應當加強對掛靠企業管理的監督檢查，及時發現并處理違反合同等情況，以確保掛靠企業真正實現專業化和規范化經營。