在申請設立外商投資合伙企業時，企業應提交以下材料：

1、申請書：應寫明申請設立外商投資合伙企業的名稱，以及投資合伙企業法律行為的行為人（外國投資者）的名稱及資料，并寫明企業設立的基本屬性、業務范圍、投資計劃等。

2、合伙協議草案：外商投資企業的合伙協議應根據實際情況確定，并由申請雙方認可。

3、外方投資者主體材料：外方投資者應提交其企業政府機關批準設立的有關文件，以及經外國投資者授權的投資代表出具的投資行為授權書。

4、中方投資者主體材料：中方投資者應提交其企業備案的法人證書、公司章程、投資者身份證明等。

5、企業正式營業執照：應提交商務、工商、稅務機關核發的正式營業執照。

6、企業注冊資金證明：應提供經中國銀行、中國農業部、中國證監會等有關機構核發的注冊資金證明，并繳納企業注冊資金。

7、其他有關資料：應提供法律顧問出具的合法性咨詢報告，以及外國投資者表明同意的該企業法律行為的證明文件等。

拓展知識：在設立外商投資合伙企業時，企業應按照《外商投資企業法》規定的屬性、業務范圍和投資計劃，提供申請書和各方簽署的合伙協議等文件，并結合中國法律對外商投資合伙企業的前期審查有嚴格的要求。在審批過程中，將結合投資企業的基本屬性、業務范圍、投資計劃等情況，以及外方投資者和中方投資者的主體資料情況，以及開辦企業是否按照法律要求繳納注冊資金、提供合法性咨詢報告等的情況，核實企業的資料后，才可以獲得外商投資企業的正式營業執照。