現(xiàn)行企業(yè)所得稅實行法人所得稅制，按照企業(yè)所得稅的立法本意，法人企業(yè)為企業(yè)所得稅納稅義務(wù)人，對企業(yè)在中國境內(nèi)設(shè)立不具有法人資格的營業(yè)機構(gòu)的，應(yīng)當匯總計算并繳納企業(yè)所得稅。但由于我國是“分灶吃飯”的財政體制，企業(yè)所得稅統(tǒng)一在總機構(gòu)所在地申報繳納，會影響地方政府經(jīng)濟利益，并且不利于調(diào)動地方政府發(fā)展的積極性。為了解決法人課稅制度與分稅制財稅管理體制的不兼容問題，在遵循《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》(中華人民共和國主席令第 63 號)所確定的法人所得稅制的基礎(chǔ)上，要求分支機構(gòu)就地預(yù)繳企業(yè)所得稅，并采取一定的財政調(diào)庫措施。根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法〉的公告》（國家稅務(wù)總局公告2012年第57號）、《國家稅務(wù)總局關(guān)于跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)所得稅征收管理問題的通知》（國稅函〔2010〕156號）等有關(guān)規(guī)定，建筑施工企業(yè)跨地區(qū)經(jīng)營繳納企業(yè)所得稅區(qū)分以下四種情況：

一、總部直接管理跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市的項目，統(tǒng)一按照經(jīng)營收入的0.2%就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。建筑企業(yè)總機構(gòu)直接管理的跨地區(qū)設(shè)立的項目部，應(yīng)按項目實際經(jīng)營收入的0.2%按月或按季由總機構(gòu)向項目所在地預(yù)分企業(yè)所得稅，并由項目部向所在地主管稅務(wù)機關(guān)預(yù)繳。以上跨地區(qū)設(shè)立的項目部，僅指建筑企業(yè)跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市設(shè)立的不具有二級分支機構(gòu)條件的項目部，且也不屬于二級或二級以下分支機構(gòu)直接管理的項目經(jīng)理部（包括與項目經(jīng)理部性質(zhì)相同的工程指揮部、合同段等）。也就是說，建筑企業(yè)跨區(qū)施工不構(gòu)成分支機構(gòu)，盡管由總機構(gòu)統(tǒng)一匯算清繳，但要在項目所在地應(yīng)預(yù)繳企業(yè)所得稅，繳納方式可以按照項目實際經(jīng)營收入的0.2%按月或按季由總機構(gòu)向項目所在地預(yù)分企業(yè)所得稅，并由項目部向所在地主管稅務(wù)機關(guān)預(yù)繳。建筑企業(yè)總機構(gòu)直接管理的跨地區(qū)設(shè)立的項目部就地預(yù)繳企業(yè)所得稅應(yīng)當提供《跨區(qū)域涉稅事項報告表》，未提供上述證明的，項目部所在地主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)督促其限期補辦；不能提供上述證明的，應(yīng)作為獨立納稅人就地繳納企業(yè)所得稅。

二、跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市設(shè)立的二級分支機構(gòu)直接組織施工項目，實行總公司提供企業(yè)所得稅“分配表”就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。企業(yè)跨地區(qū)設(shè)立不具有法人資格的二級分支機構(gòu)，應(yīng)當根據(jù)總機構(gòu)提供的分支機構(gòu)企業(yè)所得稅分配表所確定的金額就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。但以總機構(gòu)名義進行生產(chǎn)經(jīng)營的二級分支機構(gòu)，無法提供匯總納稅企業(yè)分支機構(gòu)所得稅分配表，也無法提供相關(guān)證據(jù)證明其二級及以下分支機構(gòu)身份的，應(yīng)視同獨立納稅人計算并就地繳納企業(yè)所得稅，不執(zhí)行分支機構(gòu)跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅的相關(guān)規(guī)定。

三、跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市二級以下分支機構(gòu)或項目部不用就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。二級以下分支機構(gòu)（包括項目部）不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅，其經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額統(tǒng)一計入二級分支機構(gòu)。二級以下分支機構(gòu)或項目部應(yīng)當出具《外出經(jīng)營活動稅收管理證明》，未提供上述證明的，項目部所在地主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)督促其限期補辦；不能提供上述證明的，應(yīng)作為獨立納稅人就地繳納企業(yè)所得稅。

四、同一省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市設(shè)立的跨地（市、縣）項目部或分支機構(gòu)，其企業(yè)所得稅的征收管理辦法，由各省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市國家稅務(wù)局、地方稅務(wù)局共同制定。所以，建筑企業(yè)在同一省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市設(shè)立的跨地（市、縣）項目部或分支機構(gòu)是否就地預(yù)繳以及如何預(yù)繳企業(yè)所得稅，應(yīng)視所在省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市稅務(wù)機關(guān)的具體規(guī)定。