企業查詢員工學歷的常見方式主要有以下幾種：

1. **學歷證書審核**：企業在招聘過程中或員工入職時，會要求提供學歷證書原件，通過查看證書上的信息，如學校名稱、專業、畢業時間等，進行初步審核。

2. **教育部學歷查詢系統**：中國教育部設有學歷信息網（學信網），企業可以通過該平臺驗證員工的學歷真偽。需要員工提供學歷證書編號和畢業生本人身份證號碼，通過學信網的在線驗證服務，可以查詢到學歷的詳細信息。

3. **第三方學歷驗證服務**：企業也可以委托專業的第三方背景調查公司來驗證員工的學歷。這些公司通常會與學校的教務處或檔案館聯系，獲取學歷證明文件。

4. **直接聯系學校**：企業也可以直接聯系員工畢業的學校，通過學校的教務部門或檔案館查詢學歷信息。這種方式可能需要員工的授權或者合作。

5. **線下核實**：在某些情況下，如果線上查詢存在困難，企業可能需要派人前往相關學校或教育機構進行線下核實。

拓展知識：

學歷造假在一些國家和地區是違法行為，企業在發現員工提供虛假學歷信息后，可以依據相關法律法規和公司規章制度進行處理，包括但不限于解除勞動合同、追究法律責任等。同時，企業在招聘過程中應當明確告知求職者提供虛假信息的后果，以此來預防和減少學歷造假現象的發生。