申請非營利組織免稅資格，首先應當在稅務局申請登記，由稅務局核準其非營利組織資格后方可申請免稅資格。具體步驟如下：

1、非營利組織（以下簡稱本組織）應當準備好本組織的營利性經營范圍及收入來源情況、章程（合同）、法定代表人、財務報表、關聯交易等必要資料，按要求進行登記；

2、登記完成后，本組織需要在納稅行政機關領取《納稅人識別號》（Taxpayer Identification Number）；

3、本組織需要提出申請，攜帶關聯文件及申請表到稅務行政管理部門；

4、提交申請后，本組織需要等待稅務行政管理部門受理并對本組織進行實地走訪與考察；

5、稅務行政部門考察完畢后，將擇期公布準予本組織申請的結果，本組織可以在官網查詢其獲得的免稅資格。

申請非營利組織免稅資格，除了上述步驟外，組織還應當嚴格遵守國家有關規定，合法合規經營，做到財務透明、實行精簡收入，同時組織應當及時完成報稅義務，繳納應繳稅款，方可獲得免稅資格。

拓展知識：

非營利組織免稅資格按照國家相關法規來分，一般包括以下七種：慈善組織、醫療衛生組織、文化組織、環境保護組織、社會福利機構、宗教團體和教育組織。此外，非營利組織還可以申請免征各類政府性收入，如房產稅、土地使用稅、印花稅、財產轉讓稅等。