合同性質與開票類目不一致時，首先需要核實發票申請時是否填寫對應的開票內容，確認填寫的內容與實際情況一致，如果是客戶拿錯開票類目，應當及時更正開票類目，以免影響稅率的準確計算。

其次，如果發票開出后開票類目與合同不一致，則應當立即與客戶溝通確認，如果需要更改發票，應當以書面形式發出發票更正申請，同時填寫完整的更正申請單、發票及更正原因，由主管會計人員審核附單，提交財務處更正。

最后，經過審核更正后，由財務處按照更正后的類目重新開具發票，其中新開具發票的號碼與原發票號碼一致，新發票在原發票的基礎上做出修改，把原有發票列為”舊票”，在”備注”欄做出解釋。

拓展知識：

發票更正成功后，原發票應當作廢，交回發票管理人員，實施封存，以防止泄露，確保財務安全。此外，應當在發票更正時確認客戶的開票信息，以免發生重復開票問題。同時，日常工作中應當注意檢查公司的發票內容及格式，以免發生錯誤開票類目等問題。