報關單位注冊信息的年度報告的提交方式一般有兩種，一種是現場報送，另一種是電子報送的方式。現場報送是指報關單位須將年度報告當場攜帶遞交到當地海關登記管理部門，而電子報送則是報關企業可以根據海關規定的文件，以電子報送的方式上傳到由國家海關總署指定的海關信息管理系統，由海關系統實現審核記錄和管理。一般來說，海關會通過郵件發送給報關單位有關信息，報關單位須將填寫完整的年度報告及相關的申請表以及附件電子件在要求的時間內提交到海關。如果是現場報送，報關單位在報送前須將所有報告及申請表的原件打包，并在報送時攜帶營業執照及其他注冊證件進行報送，以便海關審核。另外，報關單位也須核對自身報送信息是否準確，以及報送的文件是否齊全無誤，確保最終提交的文件安全無誤。

拓展知識：報關單位的年度報告提交，除了報送的報告信息外，報關單位也須將自身的經營、成本、收入等財務狀況隨時報送給海關，以便海關實時的進行審計，保障報關單位的安全運營。此外，為了便于海關審核，報關單位須提供準確的客戶信息，以及完整、穩健的經營模式，同時報送的文件也需按照海關的要求來填寫，最后再按照海關的規定時間報送。