分期抵扣業務的操作方式可以大致分為以下幾個步驟：

1、首先，簽訂《房地產開發公司分期抵扣協議》，該協議包括房地產開發公司的抵扣對象，抵扣金額，抵扣時期及抵扣政策等內容；

2、然后，根據協議，建立抵扣賬戶，分清收入賬戶和抵扣賬戶；

3、按照抵扣要求，在收到貨款后，將收入賬戶可提現金額轉入抵扣賬戶中；

4、隨后，將抵扣賬戶中的金額按照協議中約定的期數和金額抵扣，并及時將抵扣賬戶中的余款提取出來；

5、最后，根據協議抵扣的月度收支情況，及時對抵扣賬戶的變動進行備案登記，以備查詢。

拓展知識：自2014年起，中國政府對房地產開發企業發放分期抵扣業務進行了一系列的稅收優惠政策，政府規定的分期抵扣期數分別是6 、12、18、24 和 36 個月，具體抵扣的期數根據房地產開發企業的實際情況而定，抵扣的金額也可以根據企業的實際情況靈活調整。此外，房地產開發企業在抵扣的過程中需要做好記錄，以便在年度會計審計時能證明財務狀況的真實性。