《稅務(wù)登記管理辦法》規(guī)定：

第十條 企業(yè)，企業(yè)在外地設(shè)立的分支機(jī)構(gòu)和從事生產(chǎn)、經(jīng)營的場所，個(gè)體工商戶和從事生產(chǎn)、經(jīng)營的事業(yè)單位(以下統(tǒng)稱從事生產(chǎn)、經(jīng)營的納稅人)，向生產(chǎn)、經(jīng)營所在地稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)辦理稅務(wù)登記；

(一)從事生產(chǎn)、經(jīng)營的納稅人領(lǐng)取工商營業(yè)執(zhí)照(含臨時(shí)工商營業(yè)執(zhí)照)的，應(yīng)當(dāng)自領(lǐng)取工商營業(yè)執(zhí)照之日起30日內(nèi)申報(bào)辦理稅務(wù)登記，稅務(wù)機(jī)關(guān)核發(fā)稅務(wù)登記證及副本(納稅人領(lǐng)取臨時(shí)工商營業(yè)執(zhí)照的，稅務(wù)機(jī)關(guān)核發(fā)臨時(shí)稅務(wù)登記證及副本)；

第十四條規(guī)定，納稅人在申報(bào)辦理稅務(wù)登記時(shí)，應(yīng)當(dāng)如實(shí)填寫稅務(wù)登記表。稅務(wù)登記表的主要內(nèi)容包括：

(四)核算方式；

因此，不論分支機(jī)構(gòu)是否獨(dú)立核算，均應(yīng)在取得營業(yè)執(zhí)照之日起30日內(nèi)辦理國稅、地稅稅務(wù)登記。

根據(jù)《工商總局等六部門關(guān)于貫徹落實(shí)〈國務(wù)院辦公廳關(guān)于加快推進(jìn)“三證合一”登記制度改革的意見〉的通知》(工商企注字〔2015〕121號)文件規(guī)定，自2015年10月1日起，“三證合一”登記制度改革將在全國范圍全面實(shí)施。(注:三證是指營業(yè)執(zhí)照，組織機(jī)構(gòu)代碼證，稅務(wù)登記證)

《國家稅務(wù)總局關(guān)于落實(shí)“三證合一”登記制度改革的通知》(稅總函〔2015〕482號)規(guī)定，新設(shè)立企業(yè)、農(nóng)民專業(yè)合作社(以下統(tǒng)稱“企業(yè)”)領(lǐng)取由工商行政管理部門核發(fā)加載法人和其他組織統(tǒng)一社會信用代碼(以下稱統(tǒng)一代碼)的營業(yè)執(zhí)照后，無需再次進(jìn)行稅務(wù)登記，不再領(lǐng)取稅務(wù)登記證。企業(yè)辦理涉稅事宜時(shí)，在完成補(bǔ)充信息采集后，憑加載統(tǒng)一代碼的營業(yè)執(zhí)照可代替稅務(wù)登記證使用。

因此，如果分支機(jī)構(gòu)是按“三證合一”制度進(jìn)行登記的，不需辦理稅務(wù)登記。分支機(jī)構(gòu)需向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)完成補(bǔ)充信息采集就可。由于三證合一后，稅務(wù)具體流程程序尚未出臺明確文件規(guī)定，需按當(dāng)?shù)囟悇?wù)機(jī)關(guān)要求進(jìn)行處理。

。

《企業(yè)所得稅法》第五十條規(guī)定，居民企業(yè)在中國境內(nèi)設(shè)立不具有法人資格的營業(yè)機(jī)構(gòu)的，應(yīng)當(dāng)匯總計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅。

《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)<跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法>的公告》(國家稅務(wù)總局公告2012年第57號)規(guī)定：

第二條第一款，居民企業(yè)在中國境內(nèi)跨地區(qū)(指跨省、自治區(qū)、直轄市和計(jì)劃單列市，下同)設(shè)立不具有法人資格分支機(jī)構(gòu)的，該居民企業(yè)為跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)(以下簡稱匯總納稅企業(yè))，除另有規(guī)定外，其企業(yè)所得稅征收管理適用本辦法。

第三條規(guī)定，匯總納稅企業(yè)實(shí)行“統(tǒng)一計(jì)算、分級管理、就地預(yù)繳、匯總清算、財(cái)政調(diào)庫”的企業(yè)所得稅征收管理辦法：

第五條規(guī)定，以下二級分支機(jī)構(gòu)不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅:

(一)不具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能，且在當(dāng)?shù)夭焕U納增值稅、營業(yè)稅的產(chǎn)品售后服務(wù)、內(nèi)部研發(fā)、倉儲等匯總納稅企業(yè)內(nèi)部輔助性的二級分支機(jī)構(gòu)，不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

(二)上年度認(rèn)定為小型微利企業(yè)的，其二級分支機(jī)構(gòu)不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

(三)新設(shè)立的二級分支機(jī)構(gòu)，設(shè)立當(dāng)年不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

(四)當(dāng)年撤銷的二級分支機(jī)構(gòu)，自辦理注銷稅務(wù)登記之日所屬企業(yè)所得稅預(yù)繳期間起，不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

(五)匯總納稅企業(yè)在中國境外設(shè)立的不具有法人資格的二級分支機(jī)構(gòu)，不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

因此，貴公司與分支機(jī)構(gòu)企業(yè)所得稅實(shí)行匯總納稅辦法。需要注意的是，分支機(jī)構(gòu)在設(shè)立當(dāng)年不就地分?jǐn)偲髽I(yè)所得稅;不具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能，且在當(dāng)?shù)夭焕U納增值稅、營業(yè)稅的產(chǎn)品售后服務(wù)、內(nèi)部研發(fā)、倉儲等匯總納稅企業(yè)內(nèi)部輔助性的二級分支機(jī)構(gòu)，不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

具體分?jǐn)偡椒槿蛩胤峙浞ǎ嚓P(guān)辦法程序詳看57號公告文件。

《關(guān)于將鐵路運(yùn)輸和郵政業(yè)納入營業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)的通知》(財(cái)稅〔2013〕106號)附件1《營業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)實(shí)施辦法》規(guī)定:

第四十二條 增值稅納稅地點(diǎn)為:(一)固定業(yè)戶應(yīng)當(dāng)向其機(jī)構(gòu)所在地或者居住地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)納稅。總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)不在同一縣(市)的，應(yīng)當(dāng)分別向各自所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)納稅;經(jīng)財(cái)政部和國家稅務(wù)總局或者其授權(quán)的財(cái)政和稅務(wù)機(jī)關(guān)批準(zhǔn)，可以由總機(jī)構(gòu)匯總向總機(jī)構(gòu)所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)納稅。

第四十三條第二款 納稅人以1個(gè)月或者1個(gè)季度為1個(gè)納稅期的，自期滿之日起15日內(nèi)申報(bào)納稅;以1日、3日、5日、10日或者15日為1個(gè)納稅期的，自期滿之日起5日內(nèi)預(yù)繳稅款，于次月1日起15日內(nèi)申報(bào)納稅并結(jié)清上月應(yīng)納稅款。

《增值稅暫行條例》規(guī)定:

第二十二條 增值稅納稅地點(diǎn)：(一)固定業(yè)戶應(yīng)當(dāng)向其機(jī)構(gòu)所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)納稅。總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)不在同一縣(市)的，應(yīng)當(dāng)分別向各自所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)納稅;經(jīng)國務(wù)院財(cái)政、稅務(wù)主管部門或者其授權(quán)的財(cái)政、稅務(wù)機(jī)關(guān)批準(zhǔn)，可以由總機(jī)構(gòu)匯總向總機(jī)構(gòu)所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)納稅。

第二十三條第二款 納稅人以1個(gè)月或者1個(gè)季度為1個(gè)納稅期的，自期滿之日起15日內(nèi)申報(bào)納稅;以1日、3日、5日、10日或者15日為1個(gè)納稅期的，自期滿之日起5日內(nèi)預(yù)繳稅款，于次月1日起15日內(nèi)申報(bào)納稅并結(jié)清上月應(yīng)納稅款。

因此，分支機(jī)構(gòu)發(fā)生營改增應(yīng)稅服務(wù)，營業(yè)稅服務(wù)(不涉及建筑、不動產(chǎn))，增值稅業(yè)務(wù)(銷售、加工修理修配)均應(yīng)向分支機(jī)構(gòu)所在地申報(bào)繳納增值稅/營業(yè)稅。其中，對于營改增業(yè)務(wù)和增值稅業(yè)務(wù)，經(jīng)國務(wù)院財(cái)政、稅務(wù)主管部門或者其授權(quán)的財(cái)政、稅務(wù)機(jī)關(guān)批準(zhǔn)，可以由總機(jī)構(gòu)匯總向總機(jī)構(gòu)所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)納稅。

在實(shí)務(wù)操作中，根據(jù)分支機(jī)構(gòu)經(jīng)營范圍辦理稅種認(rèn)定，同時(shí)稅務(wù)機(jī)關(guān)確定分支機(jī)構(gòu)的納稅期限(按月或按季)。分支機(jī)構(gòu)不論是否取得應(yīng)稅收入均應(yīng)在期滿之日15日內(nèi)辦理納稅申報(bào)，沒收入辦理零申報(bào)。相應(yīng)辦理附加稅費(fèi)的申報(bào)。

分支機(jī)構(gòu)取得的工商營業(yè)執(zhí)照，屬于權(quán)利、許可證件，應(yīng)按5元/件進(jìn)行貼花。

分支機(jī)構(gòu)對外簽訂合同，如合同屬于應(yīng)稅憑證，應(yīng)進(jìn)行貼花。分支機(jī)構(gòu)的營業(yè)賬簿應(yīng)按如下規(guī)定進(jìn)行貼花:

《國家稅務(wù)局關(guān)于印花稅若干具體問題的規(guī)定》((1988)國稅地字第25號)

跨地區(qū)經(jīng)營的分支機(jī)構(gòu)使用的營業(yè)賬簿，應(yīng)由各分支機(jī)構(gòu)在其所在地繳納印花稅。對上級單位核撥資金的分支機(jī)構(gòu)，其記載資金的賬簿按核撥的賬面資金數(shù)額計(jì)稅貼花，其他賬簿按定額貼花;對上級單位不核撥資金的分支機(jī)構(gòu)，只就其他賬簿按定額貼花。為避免對同一資金重復(fù)計(jì)稅貼花，上級單位記載資金的賬簿，應(yīng)按扣除撥給下屬機(jī)構(gòu)資金數(shù)額后的其余部分計(jì)稅貼花。

《個(gè)人所得稅法》第八條規(guī)定，個(gè)人所得稅，以所得人為納稅義務(wù)人，以支付所得的單位或者個(gè)人為扣繳義務(wù)人。

《個(gè)人所得稅全員全額扣繳申報(bào)管理暫行辦法》(國稅發(fā)〔2005〕205號)規(guī)定:

第二條 扣繳義務(wù)人必須依法履行個(gè)人所得稅全員全額扣繳申報(bào)義務(wù)。

第三條 本辦法所稱個(gè)人所得稅全員全額扣繳申報(bào)(以下簡稱扣繳申報(bào))，是指扣繳義務(wù)人向個(gè)人支付應(yīng)稅所得時(shí)，不論其是否屬于本單位人員、支付的應(yīng)稅所得是否達(dá)到納稅標(biāo)準(zhǔn)，扣繳義務(wù)人應(yīng)當(dāng)在代扣稅款的次月內(nèi)，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報(bào)送其支付應(yīng)稅所得個(gè)人(以下簡稱個(gè)人)的基本信息、支付所得項(xiàng)目和數(shù)額、扣繳稅款數(shù)額以及其他相關(guān)涉稅信息。

本辦法所稱扣繳義務(wù)人，是指向個(gè)人支付應(yīng)稅所得的單位和個(gè)人。

因此，分支機(jī)構(gòu)通常有工作人員，如財(cái)務(wù)、負(fù)責(zé)人等。分支機(jī)構(gòu)向其工作人員支付工資時(shí)，屬于扣繳義務(wù)人，應(yīng)按規(guī)定代扣代繳個(gè)人所得稅。分支機(jī)構(gòu)需在當(dāng)?shù)氐囟悪C(jī)關(guān)辦理全員全額扣繳申報(bào)。